Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO8Q9NRD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO8Q9NRD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO8Q9NRD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO8Q9NRD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms