Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL1Q9NR64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms