Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBCK1Q9BYM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBCK1Q9BYM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBCK1Q9BYM8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBCK1Q9BYM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBCK1Q9BYM8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms