Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP5Q9BXF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms