Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP85Q9BW27 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP85Q9BW27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP85Q9BW27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP85Q9BW27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms