Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRC1Q96M27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRC1Q96M27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRC1Q96M27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC1Q96M27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms