Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74BQ96LY2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74BQ96LY2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74BQ96LY2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms