Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf42Q96LP6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf42Q96LP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf42Q96LP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C12orf42Q96LP6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms