Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00526Q96FQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00526Q96FQ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms