Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms