Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP40Q96DI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP40Q96DI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP40Q96DI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms