Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL26A1Q96A83 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL26A1Q96A83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL26A1Q96A83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL26A1Q96A83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL26A1Q96A83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL26A1Q96A83 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL26A1Q96A83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms