Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLNQ969V3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLNQ969V3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLNQ969V3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms