Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK9Q8TD19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK9Q8TD19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK9Q8TD19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK9Q8TD19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms