Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNERQ8NFT8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNERQ8NFT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNERQ8NFT8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms