Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RETREG2Q8NC44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RETREG2Q8NC44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RETREG2Q8NC44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms