Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPAP2Q8IXW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RPAP2Q8IXW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPAP2Q8IXW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms