Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APRG1Q8IVJ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APRG1Q8IVJ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APRG1Q8IVJ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APRG1Q8IVJ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APRG1Q8IVJ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms