Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
DZIP3Q86Y13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
DZIP3Q86Y13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DZIP3Q86Y13 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DZIP3Q86Y13 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms