Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP30Q70CQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP30Q70CQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP30Q70CQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms