Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR88Q6ZMY6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR88Q6ZMY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms