Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ANKRD40Q6AI12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD40Q6AI12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD40Q6AI12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD40Q6AI12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms