Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD12Q587J7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD12Q587J7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms