Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSF3Q4G176 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSF3Q4G176 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms