Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MINDY4Q4G0A6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MINDY4Q4G0A6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MINDY4Q4G0A6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MINDY4Q4G0A6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MINDY4Q4G0A6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms