Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CERKLQ49MI3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CERKLQ49MI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CERKLQ49MI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CERKLQ49MI3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CERKLQ49MI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms