Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGS1Q32NB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGS1Q32NB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGS1Q32NB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGS1Q32NB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms