Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ME3Q16798 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ME3Q16798 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ME3Q16798 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ME3Q16798 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ME3Q16798 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ME3Q16798 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ME3Q16798 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ME3Q16798 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ME3Q16798 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ME3Q16798 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ME3Q16798 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ME3Q16798 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ME3Q16798 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME3Q16798 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ME3Q16798 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ME3Q16798 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME3Q16798 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ME3Q16798 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ME3Q16798 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ME3Q16798 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ME3Q16798 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ME3Q16798 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ME3Q16798 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ME3Q16798 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME3Q16798 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME3Q16798 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME3Q16798 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME3Q16798 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME3Q16798 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME3Q16798 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ME3Q16798 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ME3Q16798 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ME3Q16798 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME3Q16798 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME3Q16798 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME3Q16798 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ME3Q16798 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ME3Q16798 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME3Q16798 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME3Q16798 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ME3Q16798 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ME3Q16798 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ME3Q16798 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ME3Q16798 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ME3Q16798 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME3Q16798 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
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