Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRPF4BQ13523 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF4BQ13523 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF4BQ13523 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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