Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MSLNQ13421 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSLNQ13421 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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