Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C1Q12789 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C1Q12789 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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