Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN11Q06124 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN11Q06124 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN11Q06124 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN11Q06124 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPN11Q06124 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN11Q06124 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN11Q06124 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN11Q06124 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN11Q06124 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN11Q06124 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN11Q06124 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN11Q06124 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPN11Q06124 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN11Q06124 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN11Q06124 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN11Q06124 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN11Q06124 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN11Q06124 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPN11Q06124 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN11Q06124 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms