Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms