Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRB3Q04118 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB3Q04118 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB3Q04118 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB3Q04118 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB3Q04118 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB3Q04118 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms