Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUCB1Q02818 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUCB1Q02818 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUCB1Q02818 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms