Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGCS1Q01581 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGCS1Q01581 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGCS1Q01581 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGCS1Q01581 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGCS1Q01581 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGCS1Q01581 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGCS1Q01581 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms