Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1BQ01064 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE1BQ01064 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms