Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPH1P58417 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPH1P58417 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPH1P58417 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPH1P58417 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms