Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OXCT1P55809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXCT1P55809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXCT1P55809 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms