Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN5P54829 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN5P54829 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms