Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1FP49593 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1FP49593 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1FP49593 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1FP49593 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1FP49593 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms