Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH9A1P49189 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH9A1P49189 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH9A1P49189 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH9A1P49189 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms