Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB2P47870 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB2P47870 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB2P47870 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms