Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCD1P33897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCD1P33897 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCD1P33897 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCD1P33897 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms