Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX6P30041 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX6P30041 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX6P30041 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms