Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRR2P28476 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR2P28476 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms