Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD27P26842 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD27P26842 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD27P26842 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD27P26842 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD27P26842 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD27P26842 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD27P26842 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD27P26842 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD27P26842 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD27P26842 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD27P26842 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD27P26842 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD27P26842 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD27P26842 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD27P26842 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD27P26842 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD27P26842 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD27P26842 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD27P26842 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD27P26842 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD27P26842 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD27P26842 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD27P26842 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD27P26842 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD27P26842 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD27P26842 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD27P26842 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD27P26842 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD27P26842 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD27P26842 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD27P26842 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD27P26842 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD27P26842 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD27P26842 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD27P26842 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD27P26842 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms