Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF4P23510 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF4P23510 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFSF4P23510 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms