Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SP100P23497 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP100P23497 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP100P23497 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP100P23497 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP100P23497 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP100P23497 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP100P23497 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP100P23497 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP100P23497 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP100P23497 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SP100P23497 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP100P23497 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP100P23497 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP100P23497 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SP100P23497 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SP100P23497 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP100P23497 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP100P23497 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP100P23497 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP100P23497 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP100P23497 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP100P23497 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP100P23497 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP100P23497 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP100P23497 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP100P23497 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP100P23497 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP100P23497 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP100P23497 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP100P23497 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP100P23497 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP100P23497 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP100P23497 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP100P23497 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP100P23497 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP100P23497 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP100P23497 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP100P23497 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SP100P23497 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP100P23497 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP100P23497 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP100P23497 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP100P23497 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP100P23497 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP100P23497 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP100P23497 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SP100P23497 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP100P23497 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP100P23497 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP100P23497 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP100P23497 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SP100P23497 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP100P23497 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms