Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT1P21579 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT1P21579 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT1P21579 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT1P21579 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT1P21579 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT1P21579 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT1P21579 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT1P21579 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT1P21579 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT1P21579 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT1P21579 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT1P21579 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT1P21579 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT1P21579 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT1P21579 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT1P21579 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT1P21579 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT1P21579 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT1P21579 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT1P21579 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT1P21579 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYT1P21579 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT1P21579 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT1P21579 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT1P21579 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT1P21579 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT1P21579 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT1P21579 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT1P21579 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT1P21579 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT1P21579 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT1P21579 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT1P21579 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYT1P21579 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYT1P21579 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT1P21579 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT1P21579 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT1P21579 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT1P21579 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT1P21579 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT1P21579 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT1P21579 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT1P21579 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT1P21579 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT1P21579 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT1P21579 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT1P21579 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT1P21579 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT1P21579 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT1P21579 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT1P21579 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT1P21579 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT1P21579 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT1P21579 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT1P21579 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT1P21579 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT1P21579 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT1P21579 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT1P21579 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT1P21579 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT1P21579 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT1P21579 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT1P21579 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT1P21579 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT1P21579 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYT1P21579 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYT1P21579 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT1P21579 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT1P21579 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT1P21579 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT1P21579 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT1P21579 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT1P21579 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms